มหาวิทยาลัยราชภัฏบ้านสมเด็จเจ้าพระยาเป็นสถานศึกษาที่มีการเปลี่ยนผ่านการบริหารงานโดยเริ่มจากการเป็นโรงเรียนราชวิทยาลัย (King’s College) และมีการเปลี่ยนผ่านรูปแบบการบริหารงานจากวิทยาลัยครู (Teachers College) สู่การเป็นสถาบันราชภัฏ (Rajabhat Institute) จนกระทั่งมีสถานะเป็นมหาวิทยาลัยราชภัฏ (Rajabhat University) ดังเช่นปัจจุบัน โดยในแต่ละยุคสมัยนั้นมีผู้บริหารสูงสุดทำหน้าที่บริหารจัดการสถานศึกษาสร้างความเจริญก้าวหน้ามาเป็นลำดับ นับเนื่องจากยุคแรกในตำแหน่งอาจารย์ใหญ่ ต่อมาเรียกเป็นตำแหน่งอธิการ จนถึงตำแหน่งอธิการบดีในปัจจุบัน ซึ่งผู้บริหารในแต่ละยุคสมัยล้วนแต่เป็นบุคคลที่มีบทบาทสำคัญในการสร้างความเจริญก้าวหน้าต่อมหาวิทยาลัยมาอย่างต่อเนื่อง นอกจากนี้ มหาวิทยาลัยยังได้มีการนำนามของท่านเหล่านั้นมาตั้งเป็นชื่ออาคารและชื่อห้องประชุมของมหาวิทยาลัยเพื่อให้อนุชนรุ่นหลังได้รำลึกถึงคุณูปการของบรรพชนที่ได้สร้างรากฐานอันมั่นคง ทำให้มหาวิทยาลัยมีพัฒนาการมาอย่างต่อเนื่องจวบจนปัจจุบัน

เอ.ซี.คาร์เตอร์

เอ.ซี.คาร์เตอร์
พ.ศ.๒๔๓๙ – ๒๔๔๖

หลวงบำเหน็จวรญาณ

หลวงบำเหน็จวรญาณ
พ.ศ.๒๔๔๖ – ๒๔๔๗

ขุนวิเทศดรุณการ
พ.ศ.๒๔๔๘ – ๒๔๕๘

พระประมวลวิชาพูล
พ.ศ.๒๔๕๘ – ๒๔๗๐

พระปวโรฬาร
พ.ศ.๒๔๗๐ – ๒๔๗๒

พระยาวิเศษศุภวัตร์
พ.ศ.๒๔๗๓ – ๒๔๘๐

หลวงทรงวิทยาศาสตร์
พ.ศ.๒๔๘๑ – ๒๔๘๒

หลวงภารสาร
พ.ศ.๒๔๘๓ – ๒๔๙๑

นายจรูญ วงศ์สายัณห์
พ.ศ.๒๔๙๑ – ๒๔๙๙

หลวงบุญปาลิตวิชาสาสก์
พ.ศ.๒๔๙๙ – ๒๕๐๐

นายสวัสดิ์ สิงหพงษ์
พ.ศ.๒๕๐๐ – ๒๕๐๑

นายโชค สุคันธวณิช
พ.ศ.๒๕๐๑ – ๒๕๐๔

นายพร ทองพูนศักดิ์
พ.ศ.๒๕๐๔ – ๒๕๐๘

นายศิริ ศุขกิจ
พ.ศ.๒๕๐๘ – ๒๕๑๑

นายจรูญ มิลินทร์
พ.ศ.๒๕๑๑ – ๒๕๑๘

ม.ร.ว.ทวีโภค เกษมศรี
พ.ศ.๒๕๑๘ – ๒๕๒๑

นายบุญเลิศ ศรีหงส์
พ.ศ.๒๕๒๑ – ๒๕๒๘

รศ.สุรพันธ์ ยันต์ทอง
พ.ศ.๒๕๒๘ – ๒๕๓๒

รศ.ฉลอง ภิรมย์รัตน์
พ.ศ.๒๕๓๒ – ๒๕๓๖

รศ.สันต์ ธรรมบำรุง
พ.ศ.๒๕๓๖ – ๒๕๔๖

รศ.ดร.สุพล วุฒิเสน
พ.ศ.๒๕๔๖ – ๒๕๕๕

รศ.ดร.พลสิทธิ์ หนูชูชัย
พ.ศ.๒๕๕๕ – ๒๕๕๖

ผศ.ดร.ลินดา เกณฑ์มา
๒๙ ตุลาคม ๒๕๕๘ – ๒๕๖๖

ผศ.ดร.คณกร สว่างเจริญ
๒๕๖๗ - ปัจจุบัน